Twitter: @grzegg

Skrypt do kursu „Molekularna filogenetyka roślin”

Pod adresem filogenetyka.ggoralski.pl umieściłem w formie skryptu online materiały dydaktyczne do prowadzonej przeze mnie części kursu „Molekularna filogenetyka roślin”. Są one w trakcie tworzenia. Nie są jeszcze kompletne, ukończone i dopracowane, zapewne zawierają błędy, które proszę zgłaszać w sekcji DISCUSSIONS lub za pomocą formularza „Kontakt” na tej stronie.

Prezentacja do wykładu „Drzewa filogenetyczne i Horyzontalny Transfer Genów”

Umieściłem prezentację z wykładu „Drzewa filogenetyczne i Horyzontalny Transfer Genów” w ramach kursu „Nowe osiągnięcia, odkrycia w botanice”. Do pobrania tutaj.

Jak zrobić drzewo filogenetyczne?

Umieściłem na stronie prezentację oraz pliki z danymi do prelekcji „Jak zrobić drzewo filogenetyczne?” dla sekcji biologicznej Krakowskiego Młodzieżowego Towarzystwa Przyjaciół Nauk i Sztuk. Dostępne tutaj.

Java [43] – Zadania do tablic jednowymiarowych

Dodatkowe zadania, niektóre wraz z rozwiązaniami do części ćwiczeń kursu poświęconej tablicom jednowymiarowym (wersja uaktualniona z nowym zadaniem).

. . . → Czytaj dalej: Java [43] – Zadania do tablic jednowymiarowych

Książki o programowaniu na HumbleBundle

Na Humble Bundle ciekawa promocja książek o programowaniu wydawnictwa No Starch press. Już za 1$ można stać się szczęśliwym posiadaczem pakietu takich pozycji jak „The Linux Command Line”, „You Some Erlang for Great Good!”, „Learn You A Haskell for Great Good!” czy „Teach Your Kids to Code”. Za nieco większą sumę pakiety są odpowiednio bogatsze.

. . . → Czytaj dalej: Książki o programowaniu na HumbleBundle

Darktable – teraz także dla Windows

Darktable to program, który służy do obróbki fotografii, łącznie z RAW-ami. W pewnym sensie jest to opensourcowy odpowiednik Lightrooma. Od dłuższego czasu dostępny był pod systemy Linux i Mac OSX, teraz także pojawiły się pliki instalacyjne pod Windows.

Przydatne linki:

Darktable Darktable dla Windows – informacje Darktable – informacje o najnowszej (w chwili pisania tego . . . → Czytaj dalej: Darktable – teraz także dla Windows

Przegląd edytorów tekstu

Szukając dobrego edytora tekstu, czyli podstawowego narzędzia programisty czy bioinformatyka, warto zajrzeć na to zestawienie: https://www.slant.co/topics/12/~best-programming-text-editors

Java [42] – Aplikacja uruchamiana w wierszu poleceń (CLI – command-line-interface) z przekazywanymi opcjami

Wiele programów, także bioinformatycznych, uruchamia się podając nazwę programu a także zestaw opcji, które sterują sposobem działania programu, wskazują plik wejściowy oraz wyjściowy itp. Podczas tej lekcji napiszemy tego typu aplikację, która będzie odczytywała plik zawierający sekwencje nukleotydów DNA a następnie znajdywała szukaną sekwencję, odwracała ją i zmieniała w sekwencję komplementarną.

. . . → Czytaj dalej: Java [42] – Aplikacja uruchamiana w wierszu poleceń (CLI – command-line-interface) z przekazywanymi opcjami

DriftFX – wersja 0.1.1

Dodałem nową wersję programu DriftFX. Poprawiłem wyświetlanie polskich znaków pod Windows.

DriftFX – program do prostej symulacji dryfu genetycznego

DriftFX to nowy program do prostej symulacji dryfu genetycznego. Pierwszą wersję umieściłem tutaj wraz z krótkim opisem.